Současná biologie se bouřlivě rozvíjí v oblasti genomiky. Tyto přístupy pronikají stále více do ekologie i evoluční biologie. Vznikl nový obor populační genomika, který propojuje terénní a laboratorní biologii. Využívá nové metodiky sekvenování a bioinformatických analýz, které v tomto článku stručně popisujeme a vysvětlujeme., Genomics is a rapidly developing field of modern biology. Novel genomic approaches are increasingly utilized in ecology and evolutionary biology. Population genomics has been recently established as a new discipline, connecting field and laboratory biology. It uses new sequencing methods as well as bioinformatic analyses, briefly described and explained in this article., and Helena Štorchová.
Genomická a transkriptomická studia u dvou druhů bublinatky (Utricularia gibba a bublinatky obecné - Utricularia vulgaris) přinesla průlomové poznatky. Ukázala, že miniaturní genom Utricularia gibba obsahuje zhruba stejný počet genů jako jiné kvetoucí rostliny a u některých genových rodin došlo k výrazné expanzi. To se týká např. genů zodpovědných za tvorbu kutikuly nebo za reakci na chitin, což souvisí s životním stylem této vodní masožravé rostliny. Současná nepřítomnost genů souvisejících s vývojem a funkcí kořene u obou druhů bublinatky naznačuje ztrátu „kořenových” genů u společného předka těchto druhů., Genomic and transcriptomic studies in Utricularia gibba and U. vulgaris have led to important discoveries. It was found that the miniature genome of U. gibba contained about the same number of genes as other angiosperms and that some gene families even expanded. For example, the genes responsible for cuticle development or the response to chitin are more numerous than in other plants, which may be related to the aquatic carnivorous lifestyle. Coincident absence of the genes associated with root development and function in U. gibba and U. vulgaris indicates the loss of the root genes already in their common ancestor., and Helena Štorchová.
V návaznosti na naše předchozí články tento příspěvek shrnuje a osvětluje pozoruhodné až rekordní vlastnosti vodních masožravých rostlin bublinatek (Utricularia, Lentibulariaceae) na úrovni ekofyziologické, biofyzikální i molekulárně genetické. Patří mezi ně velice rychlý vrcholový růst prýtu, rekordně vysoká rychlost fotosyntézy a velmi účinná reutilizace N a P ze starých prýtů, ale nikoliv K. Byl prokázán velmi rychlý průběh spuštění pastí, jejich spontánní spouštění bez mechanického podnětu po určité době, rozsáhlé vylučování organických látek do tekutiny pastí k podpoře pasťových mikrobních komenensálů i komplexní regulace tvorby pastí., As a follow-up to our previous papers, this paper summarises and elucidates remarkable and record-breaking eco-physiological, biophysical, and molecular characteristics of aquatic carnivorous bladderworts (Utricularia, Lentibulariaceae). These include the very rapid apical shoot growth, record high photosynthetic rate, and very effective N and P (but not K) reutilization in old shoots. Moreover, an extremely rapid time-course of trap firing, their spontaneous firing without any mechanical stimulus after certain time periods, extensive secretion of organic substances to the trap fluid to support microbial trap commensals, and a complex regulation of trap production are shown and discussed here., and Lubomír Adamec, Dagmara Sirová, Jaroslav Vrba, Jiří Bárta, Jiří Šantrůček, Karel Šimek.