Štúdium interakcie modelových α-helikálnych peptidov s lipidovými dvojvrstvami pomocou molekulovej dynamiky

Title:

Štúdium interakcie modelových α-helikálnych peptidov s lipidovými dvojvrstvami pomocou molekulovej dynamiky
Study of model α-helical peptides and lipid bilayers interaction by means of Molecular Dynamics

Creator:

Melicherčík, Milan, Urban, Ján, and Hianik, Tibor

Identifier:

https://cdk.lib.cas.cz/client/handle/uuid:33ddb783-15bf-4c81-9c08-73200b328ef6
uuid:33ddb783-15bf-4c81-9c08-73200b328ef6
issn:0009-0700

Subject:

biofyzika, peptidy, molekulární dynamika, biophysics, peptids, molecular dynamics, 6, and 53

Type:

model:article and TEXT

Format:

print, bez média, and svazek

Description:

Študovali sme interakcie α-helikálneho peptidu acetyl-K2-L24-K2-amid (L24) s lipidovými dvojvrstvami z dimyristoylfosfatidylcholínu (DMCP) v gélovom (T = 288 K) a tekutokryštalickom (T = 310 K) stave za použitia metód molekulovej dynamiky. Ukázali sme, že napriek veĺkým fluktuáciam v koncových oblastiach polárnych částí membrány, v hydrofóbnom jadre membrány zostalo α-helikálne usporiadanie peptidu zachované. Peptid spôsobil zvýšenie neusporiadanosti v gélovom stave, kým v tekutokryštalickom stave došlo k zvýšeniu usporiadania membrány v porovnaní so stavom lipidov vzdialených od peptidu. Tieto rozdiely sú typické pre prvú polovicu membrány, kým v centrálnych častiach nedošlo k zmenám v usporiadaní. Na konci 10 ns simulácie bol peptid naklonený ku kolmici na povrch membrány pod uhlom 13° v gélovom a 33° v tekutokryštalickom stave. Simulácie vykonané v časoch 5 ns, respektíve 10 ns sa výrazne nelíšili., Milan Melicherčík, Ján Urban, Tibor Hianik., and Obsahuje seznam literatury

Language:

Czech

Rights:

http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
policy:public

Coverage:

312-318

Source:

Československý časopis pro fyziku | 2006 Volume:56 | Number:5

Harvested from:

CDK

Metadata only:

false