Sledování metylace DNA u karcinomu vaječníků pomocí mikročipů

Title:

Sledování metylace DNA u karcinomu vaječníků pomocí mikročipů
Sledování metylace DNA u karcinomu vaječníků pomocí mikročipů
Monitoring of DNA methylation in ovarian cancer using microarrays

Creator:

Chmelařová, Marcela, Ruszová, E., Laco, Jan, Dvořáková, Eva, Smetana, Jan, Hrochová, Kateřina, and Palička, Vladimír

Contributor:

Chmelařová, Marcela , 1985-, Ruszová, E., Laco, Jan , 1979-, Dvořáková, Eva, Smetana, Jan, Hrochová, Kateřina, and Palička, Vladimír , 1946-

Identifier:

https://cdk.lib.cas.cz/client/handle/uuid:bmc15032813-f96552b6-0b84-4108-be39-e8d8166b791d
uuid:bmc15032813-f96552b6-0b84-4108-be39-e8d8166b791d
local:bmc15032813
http://www.cskb.cz/cskb.php?pg=casopisy--kbm--casopisy-kbm-archiv
local: bmc15032813

Subject:

nádory vaječníků--genetika, metylace DNA, mikročipová analýza, plošný screening, ambulantní monitorování, zohlednění rizika, plazma, nádorové biomarkery, časná detekce nádoru, CpG ostrůvky, molekuly buněčné adheze, kadheriny, polymorfismus genetický, ženské pohlaví, dospělí, lidé středního věku, staří, and lidé

Type:

model:article, article, Text, práce podpořená grantem, and TEXT

Format:

print, text, and regular print

Description:

Cíl: Cílem této pilotní studie byl celogenomový screening metylace DNA u pacientek s nádory ovarií. Sledování metylace bylo zaměřeno jak do promotorových oblastí vybraných genů, tak do ostrůvků bohatých na CpG. Typ studie: Pilotní studie. Materiál a metody: Do studie bylo zařazeno šest vzorků získaných od pacientek s nově diagnostikovaným ovariálním karci - nomem a šest vzorků nenádorových ovárií. Vzorky byly analyzovány pomocí zákazníkem navržených metylačních mikročipů založených na metylované-DNA imunoprecipitaci. Výsledky: Pomocí mikročipů navržených ve spolupráci se specialisty firmy HPST se nám podařilo poukázat u nádorové tká - ně na tendenci k celkové hypometylaci DNA. Dále se nám podařilo získat soubor hypermetylovaných genů ke konfirmačním analýzám. Závěr: Vzhledem k tomu, že změny v metylaci DNA jsou jedním z prvních projevů v průběhu karcinogeneze, mohly by být nalezené změny, v případě jejich průkazu v plazmě pacientek, v budoucnu využity jako screeningové markery u rizikové populace. Monitorování metylace DNA by mohlo přispět ke zlepšení péče o nemocné s ovariálním karcinomem, včetně možné finanční úspory díky včasné diagnóze a případné predikci odpovědi na léčbu, Objective: The aim of this pilot study was whole-genome screening of DNA methylation in ovarian cancer patients. Monito - ring of DNA methylation was focused on promoter regions and also on CpG islands. Design: Pilot study Material and methods: Our study included 6 samples obtained from patients with newly diagnosed ovarian cancer and 6 nonmalignant control samples of ovaries. All samples were analysed using a custom designed methylation microarrays based on the methylated DNA immunoprecipitation. Results: Using microarrays designed in collaboration with specialists of the HPST company we found in the tumor tissue tendency to overall DNA hypomethylation. Furthermore we managed to get a set of hypermethylated genes for confirmation analyses. Conclusion: DNA methylation changes are considered to be a one of the first changes during carcinogenesis. Due to this fact could be newly identified changes, in case of detection in plasma of ovarian cancer patient, used as screening markers in risk population. Monitoring of DNA methylation could contribute to improve the care of ovarian cancer patients, including possible financial saving due to early diagnosis and possible prediction of response to treatment., Chmelařová M., Ruszová E., Laco J., Dvořáková E., Smetana J., Hrochová K., Palička V., and Literatura

Language:

Czech and English

Rights:

http://creativecommons.org/publicdomain/mark/1.0/
policy:public

Relation:

Klinická biochemie a metabolismus. XII. celostátní sjezd České společnosti klinické biochemie, 20.-22. září 2015, Brno--MED00011026
Celostátní sjezd České společnosti klinické biochemie--MED00038600

Source:

Klinická biochemie a metabolismus : časopis České společnosti klinické biochemie | 2015 Volume:23 | Number:3

Harvested from:

CDK

Metadata only:

false

Date:

2015