Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a technique used to determine the chromosomal position of DNA and RNA probes. The present study contributes to knowledge on jumping plant-lice genomes by using FISH with 18S rDNA and telomeric (TTAGG)n probes on meiotic chromosomes of Psylla alni (2n = 24 + X), Cacopsylla mali (2n = 22 + neo-XY and 20 + neo-X1X2Y), C. sorbi (2n = 20 + neo-XY), Baeopelma foersteri (2n = 14 + X), and Rhinocola aceris (2n = 10 + X). This is the first study that has used FISH on the hemipteran superfamily Psylloidea. We found that the chromosomes of all studied species contain the insect-type telomere motif, (TTAGG)n. In C. mali and C. sorbi, the neo-sex chromosomes originating from autosome-sex chromosome fusions showed no interstitially located clusters of TTAGG repeats, suggesting their loss or inactivation. Similarly, no interstitial (TTAGG)n clusters were detected in an extremely large autosome pair of B. foersteri that most likely originated from a fusion of at least five ancestral chromosome pairs. Clusters of 18S rDNA were detected on the fused and second largest autosome pairs of B. foersteri and on one of the large autosome pairs of the remaining species. In C. mali and B. foersteri, the rDNA clusters were shown to coincide with the NORs as detected by the AgNOR method. Finally, we speculate, based on the obtained FISH markers, on the mechanisms of karyotype evolution of psylloid species differing in chromosome numbers and sex chromosome systems., Anna Maryańska-Nadachowska, Valentina G. Kuznetsova, Natalia V. Golub, Boris A. Anokhin., and Obsahuje bibliografii
The Tomsk region located in the south of Western Siberia is one of the most high-risk areas for tick-borne diseases due to elevated incidence of tick-borne encephalitis and Lyme disease in humans. Wild birds may be considered as one of the reservoirs for tick-borne pathogens and hosts for infected ticks. A high mobility of wild birds leads to unpredictable possibilities for the dissemination of tick-borne pathogens into new geographical regions. The primary goal of this study was to evaluate the prevalence of tick-borne pathogens in wild birds and ticks that feed on them as well as to determine the role of different species of birds in maintaining the tick-borne infectious foci. We analysed the samples of 443 wild birds (60 species) and 378 ticks belonging to the genus Ixodes Latraille, 1795 collected from the wild birds, for detecting occurrence of eight tick-borne pathogens, the namely tick-borne encephalitis virus (TBEV), West Nile virus (WNV), and species of Borrelia, Rickettsia, Ehrlichia, Anaplasma, Bartonella and Babesia Starcovici, 1893, using RT-PCR/or PCR and enzyme immunoassay. One or more tick-borne infection markers were detected in 43 species of birds. All markers were detected in samples collected from fieldfare Turdus pilaris Linnaeus, Blyth's reed warbler Acrocephalus dumetorum Blyth, common redstart Phoenicurus phoenicurus (Linnaeus), and common chaffinch Fringilla coelebs Linnaeus. Although all pathogens have been identified in birds and ticks, we found that in the majority of cases (75.5 %), there were mismatches of pathogens in birds and ticks collected from them. Wild birds and their ticks may play an extremely important role in the dissemination of tick-borne pathogens into different geographical regions., Igor G. Korobitsyn, Nina S. Moskvitina, Oleg Yu. Tyutenkov, Sergey I. Gashkov, Yulia V. Kononova, Sergey S. Moskvitin, Vladimir N. Romanenko, Tamara P. Mikryukova, Elena V. Protopopova, Mikhail Yu. Kartashov, Eugene V. Chausov, Svetlana N. Konovalova, Natalia L. Tupota, Alexandra O. Sementsova, Vladimir A. Ternovoi, Valery B. Loktev., and Obsahuje bibliografii
The local Chow Kit market is the largest wet market in the city of Kuala Lumpur. It is very close to the biggest government hospital in the city centre. However, the level of cleanliness in this area is always questionable and a matter of concern. The aim of this study was to identify the prevalence of T. gondii oocyst in water samples used by hawkers in that market and tissue cysts in rats’ brains captured from the same area. Water samples were taken to the parasitology laboratory at the National Universtiy of MalaysiaUniversity and a sugar flotation concentration method was used. Supernatant microscopical examination was then performed. A total of 752 slides were screened for the presence of T. gondii oocyst. A hundred rats wandering in the same area were also captured by the hawkers using mousetraps. After each animal was sacrificed, and an electric microtome was used to cut out serial sections 5μ thick from the rat brains. The de-waxed tissue sections were stained by the progressive Haematoxylin and Eosin (H&E) stain for microscopical examination. A total of 1000 slides were screened under a light microscope to detect the presence of T. gondii brain cysts. All the water samples were found to be negative for T. gondii oocyst. Out of the 100 rats captured, three rats were found to possess T. gondii cysts in their brains. Water samples reflect minimal or no solid food contamination, while the 3% of positive brain cysts influence the researchers to broaden their investigations for future projects., Amal R. Nimir, Tang Cher Linn, and Literatura 16
A procedure for testing occurrance of a transient change in mean of a sequence is suggested where inside an epidemic interval the mean is a linear function of time points. Asymptotic behavior of considered trimmed maximum-type test statistics is presented. Approximate critical values are obtained using an approximation of exceedance probabilities over a high level by Gaussian fields with a locally stationary structure.
This paper presents advanced methodology for the analysis of the electroencephalographic activity (EEG) of the brain aimed to monitor the cognitive states of an operator. The methodology of EEG analysis is based on two main approaches: linear methods based on Fourier transform, Linear Stochastic Models, Multi-covariance analysis, and nonlinear methods based on estimation of state space attractor, state space dimension, D2 dimension and the Largest Lyapunov Exponent (LLE). The correct application of these methods is supported by the study of stability, dynamics and space distribution of EEG signal. The uncertainty of adopting a new methodology, such as presented chaos theory, for EEG signal analysis is minimized by the adequate setup of experiments and by evaluation of results against well adopted power spectral estimates calculated by Fourier transform. For better understanding of the underlying processes behind EEG, the basic mental states such as relaxation, single and complex number count, and Raven test are analyzed and compared with the vigilance states. The averaged behavior of the computed markers of the EEG signal is studied with respect to a reaction time scale by the evaluation of a set of experiments. Because of this complex approach, the presented methodology is able to track the ongoing changes in EEG activity during the process of falling asleep. The automatic detection of vigilance changes is a consequent step to this work. Usability of such device in various fields of everyday life is of the high importance.
Cíl. Prospektivně zhodnotit možnosti detekce a charakterizace ložiskových lézí jater hepatocytárního původu při vyšetření magnetickou rezonancí po podání hepatospecifické kontrastní látky Gd-EOB-DTPA. Metoda. U 78 pacientů (67 žen, 11 mužů) s arteriálně hypervaskularizovaným jaterním ložiskem (jiným než hemangiom) nalezeným na předchozím zobrazovacím vyšetření bylo provedeno vyšetření jater magnetickou rezonancí s podáním hepatospecifické kontrastní látky Primovist (Gd-EOB-DTPA, Bayer Schering Pharma, Berlín, Německo). Všechna vyšetření byla provedena na MR přístroji firmy General Electric Signa 1,5T nativně, následovalo dynamické kontrastní zobrazení po podání kontrastní látky Primovist v arteriální, portální fázi opacifikace jater, ve fázi ekvilibria a za 20 minut. Byla hodnocena velikost, signál a charakter opacifikace, homogenita a případná přítomnost centrální jizvy. Ložiska vykazující akumulaci kontrastní látky v hepatospecifické fázi vyšetření byla považována za ložiska hepatocytárního původu. Ložiska izointenzní nebo hyperintenzní v hepatospecifické fázi byla v necirhotickém terénu považována za ložiska fokální nodulární hyperplazie, pokud jejich nativní signál a chování při dynamickém kontrastním vyšetření byl s ložisky fokální nodulární hyperplazie slučitelný Ložiska vykazující akumulaci kontrastní látky v hepatospecifické fázi vyšetření, která však byla převážně nižší ve srovnání s okolním parenchymem jater, byla v necirhotickém terénu považována za pravděpodobné adenomy Ložiska bez známek akumulace kontrastní látky v hepatospecifické fázi vyšetření byla považována v necirhotickém terénu za pravděpodobné metastázy. Výsledky. Sto jedna ložisek (u 67 pacientů) bylo označeno za ložiska fokální nodulární hyperplazie. 14 ložisek (u čtyř pacientů: 1, 1, 4 a 8 ložisek) bylo označeno za pravděpodobné adenomy, u tří pacientů byla provedena kontrola na MR bez progrese (po 24, 42, resp. 17 měsících). Jedno ložisko v necirhotickém terénu u muže bylo označeno za pravděpodobný hepatom, méně pravděpodobně adenom (histologický potvrzen adenom). Mnohočetná (desítky) ložiska u jednoho z pacientů - jaterní adenomatóza, histologický ověřeno. Dvě ložiska (u dvou pacientů) v cirhotickém terénu byla označena za pravděpodobné hepatomy U tří pacientů s onkologickým onemocněním v anamnéze byla prokázána vícečetná metastatická ložiska. Závěr. Podání hepatospecifické kontrastní látky Primovist (Gd-EOB-DTPA) významně zvyšuje potenciál magnetické rezonance pro specifikaci ložiskových lézí jater hepatocytárního původu, zvláště užitečné je pro diagnostiku ložisek fokální nodulární hyperplazie, kdy umožňuje s velkou pravděpodobností potvrdit tuto diagnózu bez nutnosti histologické verifikace. Velkým přínosem jejího podání je také odlišení hypervaskularizovaných metastáz od ložisek hepatocytárního původu., Aim. To prospectively evaluate the possibilities of detection and characterization of hepatocellular liver lesions by means of MRI using hepatospecific contrast agent Gd-EOB-DTPA. Method. A total of 78 subjects (67 females, 11 males) with known arterial hypervascularized liver lesion (other than haemangioma) were examined on MRI with administration of liver specific contrast agent Primovist (Gd-EOB-DTPA, Bayer Schering Pharma, Berlin, Germany). All studies were performed on General Electric Signa 1.5T system before and after Primovist contrast agent injection in arterial, portal venous, equilibrium phases, and at twenty minutes past injection. Size, signal, enhacement pattern, homogeneity, and presence of central scar were evaluated. Lesions with contrast agent accumulation in liver specific phase were considered to be of hepatocellular origin. Iso-/hyperintense lesion in liver specific phase was in non-cirrhotic liver considered to be focal nodular hyperplasia provided the features on precontrast and dynamic contrast studies were in keeping with this diagnosis. Lesion showing signal increase in liver specific phase, however to a lesser degree than normal non-cirrhotic liver parenchyma was considered to be adenoma. Lesion showing no enhacement in liver specific phase was diagnosed as metastasis. Results. 101 focal nodular hyperplasias (in 67 subjects) were diagnosed. 14 adenomas (in 4 subjects with 1, 1,4, and 8 lesions, respectively) were found; three subjects were available to MRI follow-up without progression (after 24, 42, and 17 months, respectively). A single lesion in non-cirrhotic liver was thought to be a hepatoma, less likely an adenoma (adenoma confirmed on biopsy). A single patient presented with tens of lesions due to liver adenomatosis (histologically verified). Two lesions in two patients with liver cirrhosis were diagnosed as hepa-tomas. Three oncological patients were diagnosed with liver metastases. Conclusion. Administration of liver specific contrast agent Primovist (Gd-EOB-DTPA) improves specification of hepatocellular liver lesions, particularly in cases of focal nodular hyperplasia where non-invasive diagnosis can be made with high accuracy. Also, differentiation between hypervascularized metastases and lesions of hepatocellular origin is very beneficial., Mrklovský M, Klzo L, Žižka J., and Literatura 33
Cíl práce: 1. zavedení, optimalizace a validace polymerázové řetězové reakce v realném čase pro detekci DNA borélií včetně kontroly přítomnosti inhibitorů DNA polymerázy; 2. shrnutí dosavadních výsledků získaných pomocí zavedené metody. Materiál a metody: Izolace DNA byla prováděna pomocí komerčního kitu MagNA Pure Isolatin Kit III (Bacteria, Fungi) na automatickém izolačním přístroji MagNA Pure LC fi rmy Roche. Metoda byla koncipována jako multiplex real-time PCR s amplifi kací DNA borélií a koamplifi kací inhibiční kontroly v jedné zkumavce. Výsledky: Zavedená metoda byla plně optimalizována, validována a následně použita pro vyšetření 1822 materiálů, z toho 1151 likvorů, 609 krví a 62 jiných materiálů. Pouze 17 vzorků bylo pozitivních a 4 vzorky vykazovaly přítomnost inhibitorů DNA polymerázy. Závěr: Námi zavedená a validovaná metoda je velice rychlá, citlivá a specifi cká pro detekci DNA borélií. Přesto v diagnostice lymeské boreliózy není vždy stoprocentně spolehlivá a klinická korelace, stejně jako u jiných metod, není uspokojivá., Objective: The aims of our work were to introduction, optimization and validation of real-time PCR for detection Borrelia DNA including control of DNA polymerase inhibitors presence and summary of the results obtained by the new method. Material and methods: DNA was isolated by commercial kit MagNA Pure Isolatin Kit III (Bacteria, Fungi) on automatic isolation instrument MagNA Pure LC (Roche). The method is created as multiplex real-time PCR with Borrelia DNA amplifi cation and co-amplifi cation of inhibitor control in one tube. Results: Established method was optimised, validated and then used for analysis of 1,822 biological materials, of it 1,151 cerebrospinal fl uids, 609 blood samples and 62 other biological samples. Only 17 samples were positive and 4 samples contained inhibitors of DNA polymerase. Conclusion: The established and validated method is very fast, sensitive and specifi c for detection of Borrelia DNA. In spite of, Lyme borreliosis diagnostics is not always unimpeachable and clinical correlation is not satisfactory as well as other methods., Bolehovská R., Plíšková L., Plíšek S., Čermáková Z., Honegr K., Palička V., and Lit.: 13
Cíl: Článek popisuje případ 24letého muže s ektopickou žaludeční sliznicí a krvácením do trávicího traktu. Divertikl je někdy vystlán ektopickou žaludeční sliznici, což může vést ke vzniku peptického vředu a krvácení. Diagnostika tohoto krvácení je obtížná a významně se může uplatnit scintigrafie Meckelova divertiklu. Materiál a metoda: 24letý muž podstoupil scintigrafii s 99mTc-pertechnetátem pro časově aktuální anamnézu krvácení do trávicího traktu z neznámého zdroje (enteroragie, hemoragická anémie). Morfologické zobrazovací metody (gastroskopie, koloskopie, enteroklýza, USG a CT) byly negativní včetně scintigrafie s radioaktivně označenými erytrocyty. Výsledky: Scintigrafie zjistila přítomnost ektopické žaludeční sliznice v oblasti ilea. Pacient podstoupil operaci, chirurg resekoval část proximálního ilea včetně Meckelova divertiklu, ve kterém se podle histologie nacházela ektopická žaludeční sliznice. Po operaci došlo ke stabilizaci krevního obrazu. Závěr: Scintigrafie Meckelova divertiklu pomohla detekovat ektopickou žaludeční sliznici a zkrátila diagnostický proces u pacienta s krvácením do trávicího traktu., Jiří Doležal, and Lit. 19
Cíl: Prezentovat zajímavý případ 44leté ženy s metastázou karcinomu prsu v axilární lymfatické uzlině vpravo s negativní mamografií, biopsií a ultrasonografií prsů, kdy 18F-FDG PET/CT odhalil multifokální karcinom prsu vpravo. Materiál a metoda: Pacientka vyhledala lékaře pro hmatnou rezistenci v pravé axile. Následovala exstirpace paketu lymfatických uzlin z pravé axily, histologické vyšetření prokázalo metastázu karcinomu prsu. Mamografie a ultrasonografie obou prsů byla s negativním výsledkem. Vzhledem k pozitivitě metastáz v lymfatických uzlinách v pravé axile následovala ještě biopsie z pravého prsu, také s negativním nálezem. V rámci pátrání po primárním ložisku karcinomu prsu pacientka absolvovala celotělové PET/CT zobrazení v rozsahu od baze lební do proximální třetiny stehen, a to 60 minut po intravenózní aplikaci radiofarmaka 18F-FDG o aktivitě 377 MBq (5 MBq/kg). Akviziční čas PET skenu byl 2,5 minuty na 15 cm projekci, celkem 7 projekcí. Kontrastní (i.v. + per os kontrast) CT sken byl proveden ve venózní fázi. Výsledky: PET/CT odhalil multiložiskový viabilní tumor v laterální části pravého prsu a viabilní metastázy v lymfatických uzlinách v pravé axile a infraklavikulárně vpravo. Závěr: 18F-FDG PET/CT správně detekoval multifokální karcinom prsu u pacientky s pozitivní metastázou tohoto karcinomu v lymfatické uzlině a neznámým primárním ložiskem, čímž zkrátil dobu diagnostického procesu a umožnil zvolit správnou léčbu., Aim: To present a rare case report of the multifocal breast cancer finding on 18F-FDG PET/CT in a 44-year-old woman with the positive right axillary breast metastases and negative mammography, ultrasound and right breast biopsy. Material and Method: The patient underwent 18F-FDG PET/CT for the positive right axillary lymph node breast cancer metastases and negative mammography, ultrasound a right breast biopsy. The whole body PET/CT was obtained 60 minutes after intravenous injection of 18F-FDG (377 MBq – 5 MBq/kg). The PET scan acquisition time was 2.5 minutes per bed position for whole body imaging from base of the skull to mid femur and seven bed positions were necessary. Contrast-enhanced CT (venous phase) provided both full CT evaluation (including intravenous and oral contrast) and PET attenuation correction. Results: The examination revealed PET/CT positive multifocal tumour in the right breast and regional metastases in the right axilla and infraclavicular region without distant metastases. The patient underwent the subsequent neoadjuvant chemotherapy, surgery and adjuvant radiotherapy and the complete remission was induced. Conclusion: The 18F-FDG PET/CT revealed multifocal breast cancer, improved patient management and allowed subsequent successful treatment., Jiří Doležal, Dagmar Kalousová, Igor Sirák, Dana Dvořáková, and Literatura